在对外交流与合作方面，学院积极拓展国际视野，先后与俄罗斯、美国、日本、澳大利亚、马来西亚、印度、吉尔吉斯斯坦等十余个国家的知名高校和医疗机构建立了友好合作关系，开展广泛的国际合作与学术交流。学院与俄罗斯赤塔国立医学院合作举办临床医学、口腔医学、精神医学3个专业本科教育项目，在尼泊尔和吉尔吉斯斯坦建立了“齐齐哈尔医学院临床病理诊断分中心”，获批招收培养“来华留学黑龙江省政府奖学金生”资质和来华留学生研究生招收资格，获批欧亚国家留学生奖学金项目。